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主题 : 我被NCBI服务器BLOCK了
伍胥之 离线
级别: 军区司令员

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楼主  发表于: 2007-12-29   

我被NCBI服务器BLOCK了

超级郁闷!我居然被NCBI(National Center for Biotechnology Information)的服务器列入黑名单了,这个网站我可是几乎一天都离不了的。 2'x_zMV  
%WO;WxG8^  
打开www.ncbi.nlm.nih.gov, 给我来了上面这个吓人的页面。
图片:NCBI Blocked Me.jpg
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伍胥之 离线
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沙发  发表于: 2007-12-29   
再重复刷新也还是这人样子,终于想出来原因了。因为它认为我对它的服务器进行攻击了,倒也不是冤枉我,虽然事实上我并没有攻击它的想法和动机。 "@ f`O  
]Wy V bIu  
NCBI的BLAST服务是我们经常用到的,用来对某个序列进行同源分析或查找与待分析DNA/mRNA序列相似的序列。它除了WWW方式外,还有一个叫NetBLAST的客户端程序,用来以命令行方式运行,可以方便地处理大量的待分析序列。 ,)QmQ ^/  
qGh rJ6R!  
俺比较爱多事,看好了它这个功能后干脆自己写了一个调度程序来控制NetBLAST的运行,其实说白了就是设定一个数值,然后检查NetBlast的instance数量,如果不够设定值就再启动一个新的instance来分析下一个文件。所以经常把几千个序列让它一起分析,设上同时分析30-40个文件,然后就开着电脑回家睡觉,第二天就差不多分析完了。 y'+^ ME$H  
/ _cOg? o  
可是问题可能就出在这里,昨天晚上我本来要输入50或100的,可是不知道是输入了500还是1000,反正是多输了一个0,结果我的电脑在疯狂打开新的NETBLAST进程,这时我的程序就基本没反应了(有反应也没用了,那个检查循环结束之前即使响应新的事件也没有用,程序中有一个不算BUG的虫子,只在循环开始的时候检查预定的进程数目,中间不检查)。所以,我眼睁睁地看着我的电脑CPU利用率在90%上下波动,磁盘在疯狂地读写(估计页面交换文件不知道读写了多少遍),我费了九牛二虎之努力后,终于让它暂停下来,此时我的电脑中在运行的进程数为1000多个,又过了好半天才把这些处理完。 x Apa+j6I  
k5ZwGJ#r  
估计服务器这时把我列入了恶意攻击的黑名单了,想想如果一台机器同时有上千个进程访问同一服务器,不当作对服务器的恶意攻击才怪! HQE#O4  
c{852R  
问题是我当时还没有意识到这一点,程序接下来按同时运行100进程的设定在“正常”运行,我看了一会电视回来发现进展速度非常非常快,进行管理器显示有大量的进程很快终止,我的程序每2秒检查一次NetBLAST进程数,每次都需要重要打开40-60个新进程,而结束的进程所得到的数据文件全是空的!得!白干了。 d[S!e`,iD  
n;q7? KW8  
直到今天我以WWW方式访问NCBI,才发现俺早被列入黑名单了。原来我昨天晚上程序恢复正常后所作的工作就是向NCBI服务器证明俺就是屡教不改。 %V+,#  
W&*{j;e9%I  
没有NCBI的日子该怎么过呢?
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伍胥之 离线
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板凳  发表于: 2007-12-29   
按照上面页面给提示的信箱,给NCBI写了一封信,不知道会不会有结果和多长时间才会有结果。想想NCBI的服务器都是超级计算机,应该不会因为俺的误操作就让它死机或造成别的损失。 ec3('}X  
@lJGdp  
NCBI不会来找俺的麻烦吧?好怕怕噢!!!
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admin 离线
级别: 管理员

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地板  发表于: 2007-12-29   
汗! I@z{G r  
前两天攻击BAC服务器的, \u)(+t{  
不是你吧?
http://www.bachinese.com
Bay Area Chinese Forum  灣區華人網站
Serving the San Francisco Bay Area [Silicon Valley] Chinese Community
服務舊金山灣區[硅谷/矽谷]華人社區
伍胥之 离线
级别: 军区司令员

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地下室  发表于: 2007-12-29   
引用
引用第3楼admin于2007-12-30 04:40发表的  : ,sc>~B@Q  
汗! SKS[Lf  
前两天攻击BAC服务器的, g =%W"v  
不是你吧?
%\^x3wP&o\  
'WOW m$2  
俺木油这个水平啊!俺并不会网络攻击技术,俺所做的也是正常的工作,只不过从流量上看具有攻击嫌疑。 *i\7dJ Dj  
Jrffb=+b  
正好赶上过节,没人理俺,给NCBI写信也没有回音,现在俺仍然处于BLOCKED状态。
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jasmine 离线
级别: 论坛版主
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5楼  发表于: 2007-12-29   
不然就换一个IP, 在电脑上再加一个网卡,用这个网卡上网,把其它的网卡先disable 掉, 再换个用户名子。
很报歉, 我因为基本不用 “好友” 功能, 又不想引起误会, 所以把所有的 existing  好友都删了。 如果有事, 请短信我, 谢谢。
伍胥之 离线
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6楼  发表于: 2007-12-29   
引用
引用第5楼jasmine于2007-12-30 13:32发表的  : oZ=e/\[K  
不然就换一个IP, 在电脑上再加一个网卡,用这个网卡上网,把其它的网卡先disable 掉, 再换个用户名子。
0p#36czqy  
`\qU.m0(j  
4dy)g)wM  
此路也不通啊!俺的IP是ISP分配给俺的固定IP,自己不能更换的。现在只能是跟NCBI联系让他们取消。不过现在可能是假期,没有反应。 S1=c_!q%9  
2T|L# #C  
谢谢茉莉花的建议,祝新年快乐!!!
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jasmine 离线
级别: 论坛版主
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7楼  发表于: 2007-12-29   
不客气。。。 Gook luck with NCBI....
很报歉, 我因为基本不用 “好友” 功能, 又不想引起误会, 所以把所有的 existing  好友都删了。 如果有事, 请短信我, 谢谢。
fay924 离线
级别: 新兵蛋子
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8楼  发表于: 2008-02-17   
楼主,你好! cAL&>T  
      我想向你请教一下关于NetBlast的问题。当我用 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d mouse_contig/genome -o chr1_NM_000036.out 来进行blastn时“No hits found”,可能是数据库参数错误。我又试 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d chromosome -u "mouse" -o chr1_NM_000036.out 时,程序跑了一夜,第二天看时虚拟内存不够,晕! [oYe/<3  
      对于 -d 数据库的参数我不是很清楚。另外,能否借鉴一下你的用来控制blastcl3运行的调度程序,我有好几百条序列要分析。 k!%HcU%J  
      先谢啦!
伍胥之 离线
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9楼  发表于: 2008-02-19   
引用
引用第8楼fay924于2008-02-18 09:58发表的 : U M#]olh  
楼主,你好! 3 $RII -}>  
      我想向你请教一下关于NetBlast的问题。当我用 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d mouse_contig/genome -o chr1_NM_000036.out 来进行blastn时“No hits found”,可能是数据库参数错误。我又试 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d chromosome -u "mouse" -o chr1_NM_000036.out 时,程序跑了一夜,第二天看时虚拟内存不够,晕! }%:?s6Ler  
      对于 -d 数据库的参数我不是很清楚。另外,能否借鉴一下你的用来控制blastcl3运行的调度程序,我有好几百条序列要分析。 !<~Ig/  
      先谢啦!
~L1N1Z)Kk  
R `'@$"  
9 np<r82  
呵呵,俺不过发了一个牢骚,居然被人搜索到这个地方,专门注册了跟来问这个问题。看来在网络上要小心啊! jLEU V  
7'<4'BGzl]  
1. 我把源程序给你发到信箱,你自己用用试试吧!不过你只做几百条序列的BLAST好象并不需要用这个程序。 gG $o8c-  
M r&]RTEE  
2. 你用-d参数指定的数据库不正确。 请参看NetBLAST客房端的帮助文件,可以先考虑使用nr参数。 QzS{2Y[OQ  
/wK7l-S  
3. 如果你需要用-u参数来限定mouse的序列,你应该使用-u "mouse[organism]"
杺栫杣杊椌柮栬,䒴蓉艿芖。
clean0551 离线
级别: 论坛版主

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10楼  发表于: 2008-02-19   
我文盲啊,看不懂这个贴子.悲.
俺的博客~欢迎来踩!
http://clean0551.blog.tianya.cn/
panther 离线
级别: 新兵蛋子
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11楼  发表于: 2009-10-13   
哈哈.. 都07年的事了~ 现在怎样了??  能正常使用NCBI了??
噜噜 离线
级别: 营长
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12楼  发表于: 2009-10-14   
看了楼上的才注意,原来是07年的事情了。现在应该可以了吧?俺以前也遇到过这种情况呢
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