我被NCBI服务器BLOCK了

超级郁闷！我居然被NCBI(National Center for Biotechnology Information)的服务器列入黑名单了，这个网站我可是几乎一天都离不了的。 ,T{oy:rB  
5VKcV&D  
打开www.ncbi.nlm.nih.gov, 给我来了上面这个吓人的页面。

再重复刷新也还是这人样子，终于想出来原因了。因为它认为我对它的服务器进行攻击了，倒也不是冤枉我，虽然事实上我并没有攻击它的想法和动机。 G0/>8_Q>Nr  
Pin/qp&Fa8  
NCBI的BLAST服务是我们经常用到的，用来对某个序列进行同源分析或查找与待分析DNA/mRNA序列相似的序列。它除了WWW方式外，还有一个叫NetBLAST的客户端程序，用来以命令行方式运行，可以方便地处理大量的待分析序列。 'hF@><sqk  
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俺比较爱多事，看好了它这个功能后干脆自己写了一个调度程序来控制NetBLAST的运行，其实说白了就是设定一个数值，然后检查NetBlast的instance数量，如果不够设定值就再启动一个新的instance来分析下一个文件。所以经常把几千个序列让它一起分析，设上同时分析30-40个文件，然后就开着电脑回家睡觉，第二天就差不多分析完了。 :XYy7xz<  
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可是问题可能就出在这里，昨天晚上我本来要输入50或100的，可是不知道是输入了500还是1000，反正是多输了一个0，结果我的电脑在疯狂打开新的NETBLAST进程，这时我的程序就基本没反应了(有反应也没用了，那个检查循环结束之前即使响应新的事件也没有用，程序中有一个不算BUG的虫子，只在循环开始的时候检查预定的进程数目，中间不检查)。所以，我眼睁睁地看着我的电脑CPU利用率在90%上下波动，磁盘在疯狂地读写(估计页面交换文件不知道读写了多少遍），我费了九牛二虎之努力后，终于让它暂停下来，此时我的电脑中在运行的进程数为1000多个，又过了好半天才把这些处理完。 c3#q0Ma  
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估计服务器这时把我列入了恶意攻击的黑名单了，想想如果一台机器同时有上千个进程访问同一服务器，不当作对服务器的恶意攻击才怪！ 6c&Y  
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问题是我当时还没有意识到这一点，程序接下来按同时运行100进程的设定在“正常”运行，我看了一会电视回来发现进展速度非常非常快，进行管理器显示有大量的进程很快终止，我的程序每2秒检查一次NetBLAST进程数，每次都需要重要打开40-60个新进程，而结束的进程所得到的数据文件全是空的！得！白干了。 ^yJ:+m;6K  
h)@InYwu7  
直到今天我以WWW方式访问NCBI，才发现俺早被列入黑名单了。原来我昨天晚上程序恢复正常后所作的工作就是向NCBI服务器证明俺就是屡教不改。 sOz sY7z3Z  
ESv:1o`?n  
没有NCBI的日子该怎么过呢？

按照上面页面给提示的信箱，给NCBI写了一封信，不知道会不会有结果和多长时间才会有结果。想想NCBI的服务器都是超级计算机，应该不会因为俺的误操作就让它死机或造成别的损失。 m|1n x  
; RHNRVP  
NCBI不会来找俺的麻烦吧？好怕怕噢！！！

汗！ Y
1y E  
前两天攻击BAC服务器的， C{&)(#*L  
不是你吧？

引用

引用第3楼admin于2007-12-30 04:40发表的  : Spo+@G  
汗！  i6 L  
前两天攻击BAC服务器的， #_fY4vEO  
不是你吧？

gn.Ol/6D  
a(|x w  
俺木油这个水平啊！俺并不会网络攻击技术，俺所做的也是正常的工作，只不过从流量上看具有攻击嫌疑。 GoD ?KC  
Sn ^Aud  
正好赶上过节，没人理俺，给NCBI写信也没有回音，现在俺仍然处于BLOCKED状态。

不然就换一个IP， 在电脑上再加一个网卡，用这个网卡上网，把其它的网卡先disable 掉， 再换个用户名子。

引用

引用第5楼jasmine于2007-12-30 13:32发表的  : LU(%K{9  
不然就换一个IP， 在电脑上再加一个网卡，用这个网卡上网，把其它的网卡先disable 掉， 再换个用户名子。

O#G| ~'.,  
u<kD}  
;dOs0/UM&  
此路也不通啊！俺的IP是ISP分配给俺的固定IP，自己不能更换的。现在只能是跟NCBI联系让他们取消。不过现在可能是假期，没有反应。 `M)E*G  
<soj&f+  
谢谢茉莉花的建议，祝新年快乐！！！

不客气。。。 Gook luck with NCBI....

楼主，你好！ ] R<FKJ[  
      我想向你请教一下关于NetBlast的问题。当我用 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d mouse_contig/genome -o chr1_NM_000036.out 来进行blastn时“No hits found”，可能是数据库参数错误。我又试 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d chromosome -u "mouse" -o chr1_NM_000036.out 时，程序跑了一夜，第二天看时虚拟内存不够，晕！ `#U ]iwW!  
      对于 -d 数据库的参数我不是很清楚。另外，能否借鉴一下你的用来控制blastcl3运行的调度程序，我有好几百条序列要分析。 o\60n  
      先谢啦！

引用

引用第8楼fay924于2008-02-18 09:58发表的 : )2]a8JVf  
楼主，你好！ C d| W#.6  
      我想向你请教一下关于NetBlast的问题。当我用 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d mouse_contig/genome -o chr1_NM_000036.out 来进行blastn时“No hits found”，可能是数据库参数错误。我又试 blastcl3 -p blastn -i chr1_NM_000036.gene -d chromosome -u "mouse" -o chr1_NM_000036.out 时，程序跑了一夜，第二天看时虚拟内存不够，晕！ /6jGt'^U  
      对于 -d 数据库的参数我不是很清楚。另外，能否借鉴一下你的用来控制blastcl3运行的调度程序，我有好几百条序列要分析。 A!4VjE>  
      先谢啦！

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3`ml; L?D  
呵呵，俺不过发了一个牢骚，居然被人搜索到这个地方，专门注册了跟来问这个问题。看来在网络上要小心啊！ %Zu
Ll(  
?UJSxL  
1. 我把源程序给你发到信箱，你自己用用试试吧！不过你只做几百条序列的BLAST好象并不需要用这个程序。 Ge0Lb+<G  
>|(%2Zl  
2. 你用-d参数指定的数据库不正确。 请参看NetBLAST客房端的帮助文件，可以先考虑使用nr参数。 {wv&t R;  
zv@bI~3~  
3. 如果你需要用-u参数来限定mouse的序列，你应该使用-u "mouse[organism]"

我文盲啊,看不懂这个贴子.悲.

哈哈.. 都07年的事了~ 现在怎样了??  能正常使用NCBI了??

看了楼上的才注意，原来是07年的事情了。现在应该可以了吧？俺以前也遇到过这种情况呢